Merkisteinn er önnur af tvemur yngri deildum skólans. Þar eru 5 starfsmenn, 4 í 100% starfi og 1 í 80%.
Á deildinni eru 19 börn tveggja til þriggja ára.
| Steinunn Magnadóttir (í fæðingarorlofi) | Deildarstjóri/leikskólakennari | 80% |
| Ylfa Jónsdóttir | Afleysing Deildarstjóra/BA í fatahönnun | 100% |
| Rannveig Iðunn Ásgeirsdóttir | Aðstoðarleikskólakennari | 100% |
| Athina Asimakopoulou | Leiðbeinandi | 100% |
| Birgir Einar Jónsson | Leiðbeinandi | 100% |
Dagskipulag Merkisteins
| 07:30-08:00 | Móttaka barna á Lækjarhvammi |
| 08:00-08:50 | Morgunmatur |
| 09:05-09:25 | Hópastarf |
| 09:25-09:50 | Samvera/ávaxastund |
| 09:50-10:15 | Fataklefi |
| 10:15-11:20 | Útivera/innivera |
| 11.20-11.30 | Söngstund |
| 11:30-12:15 | Hádegisverður |
| 12:15-14:30 | Hvíld/frjáls leikur/útivera |
| 14:30-15.00 | Nónhressing |
| 15.00-15:15 | Lestrarstund |
| 15:15-17:00 | Frjáls leikur/útivera |
| 17:00 | Leikskólinn lokar |